从东直门到北京南站，您可以选择地铁作为主要的交通方式。具体的地铁线路和时长如下：

1. 从东直门地铁站乘坐2号线（也就是环线）地铁，向东南方向行驶。

2. 经过一系列站点，包括东直门站、三元桥站等，然后换乘地铁1号线八通线。

3. 沿着地铁线路继续行驶，经过四惠站、大望路站等站点。

4. 在建国门站换乘地铁建国线后继续向南开往西单站方向行驶。然后在西直门站换乘地铁4号线大兴线。最后在北京南站下车即可到达北京南站。整个行程大约需要半小时左右的时间。不过，请注意根据实际的交通状况预留时间，可能会存在时间上的差异。

此外，您也可以选择打车前往北京南站，大约需要半小时左右的时间到达，但费用可能会因路况和天气等因素有所波动。建议您根据实际情况选择合适的交通方式出行。